Род Годуновых выдвинулся на первый план в годы правления Ивана Грозного. Начало их возвышению положил Дмитрий Годунов, а продолжил его племянник Борис, который стал опричником и вошел в ближний круг царя. Сестра Бориса, Ирина, была выдана замуж за царевича Федора, сына Грозного, что еще больше укрепило положение семьи.
После смерти Ивана IV в 1584 году на престол взошел Федор Иоаннович. Фактическим правителем при нем стал шурин, Борис Годунов, проявивший себя как умный и расчетливый государственный деятель. Его правление ознаменовалось как успехами во внешней политике, так и тяжелейшими внутренними потрясениями, такими как Великий голод. Пресечение династии Рюриковичей со смертью Федора в 1598 году открыло путь к трону. Земский собор избрал царем Бориса Годунова.
Однако его царствование было омрачено всеобщим недовольством и появлением самозванца, выдававшего себя за чудом спасшегося царевича Дмитрия. После внезапной кончины Бориса в 1605 году трон ненадолго перешел к его сыну, Федору Борисовичу, юноше, подававшему большие надежды. Но вскоре он был свергнут и убит сторонниками Лжедмитрия I. Так трагически прервалась прямая царская линия Годуновых.
Смутное время, начавшееся с их падения, поглотило страну на долгие годы. Период междуцарствия, войн и интервенции завершился лишь в 1613 году, когда Земский собор призвал на царство Михаила Федоровича Романова, положив начало новой династии. Романовы приходились родственниками первой жене Ивана Грозного, Анастасии, и тем самым были косвенно связаны с прежним кругом, куда входили и Годуновы. Их воцарение подвело черту под одной из самых драматичных эпох в русской истории.